一、承担主体不同
1、五险一金
养老保险、医疗保险和失业保险，这三种险和住房公积金是由企敬数扰业和个人共同缴纳的保费，工伤保险和生育保险完全是由企业承担的，个人不需要缴纳。医疗保险则是由国家、企业和个人共同承担的。
2、农村合作亮旦医疗
采取个人缴费、集体扶持和政府资助的方式筹集资金。
二、包含项目不同
1、五险一金
指用人单位给予劳动者的几种保障性待遇的合称，包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险，及住房公积金。530*363
2、农村合作医疗
国家针对农民实施的一项医疗保障制度，不包含其他保险类的制度。
三、实施方式不同
1、五险一金
其中的社会保险是国家通过立法强制实行的，需要用人单位和个人强制缴纳所需部分。
2、农村合作医疗
指由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。
扩展资料：
2013年9月11日，国家卫生和计划生育委员会下发《关于做好2013年新型农村合作医疗工作的通知》：
自2013年起，各级财政对新农合的补助标准从每人每年240元提高到每人每年280元。政策范围内住院费用报毕雹销比例提高到75%左右，并全面推开儿童白血病、先天性心脏病、结肠癌、直肠癌等20个病种的重大疾病保障试点工作 。
2014年5月27日据财政部网站消息，财政部、国家卫生计生委、人力资源社会保障部4月25日发布《关于提高2014年新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险筹资标准的通知》，2014年新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险筹资方法为：
1、各级财政对新农合和居民医保人均补助标准在2013年的基础上提高40元，达到320元。其中：中央财政对原有120元的补助标准不变，对200元部分按照西部地区80%和中部地区60%的比例安排补助，对东部地区各省份分别按一定比例补助。
2、农民和城镇居民个人缴费标准在2013年的基础上提高20元，全国平均个人缴费标准达到每人每年90元左右。个人缴费应在参保（合）时按年度一次性缴清。
参考资料：百度百科-五险一金
参考资料：百度百科-农村合作医疗
五险一金和农村合作医疗有区别：
1.范围不同
五险： 养老、工伤、医疗、失业和生育保险。一金，就是住房公积金。
农村合作医疗只有医疗内容。
2.对象不同
五险一金通常人单位给予劳动者保障性待遇。
农村合作医疗通常针对农民或农村户口人员。
3.性质不同
社保属于强制性实施的，用人单位和劳动者建立劳动关系，必须购买社保；
农村合作医疗属于自愿参加。 五险一金 是指用人单位给予劳动者的几种保障性待遇的合称，包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险，还有住房公积金。旁毁 “五险”指的是五种保险，包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险；“一金”指的是住房公积金。其中养老保险、医疗保险和失业保险，这三种险和住房公积金是由企业和个人共同缴纳的保费，工伤保险和生育保险完全是由企业承担的，渣弊个人不需要缴纳。缴纳社会保险是国家强制性的要求，不是想缴不想缴的事情，请注意，国家文件里的都写得是缴纳，缴纳带有强制性的意思，和交纳含义是不一样的，如果不缴纳，会受到相应的处罚。关于公积金，是根据企业效益而定，如果效益不好，可以自己确定比例，不属于社会保险范畴。 农村合作医疗
是指由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和如启族政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。采取个人缴费、集体扶持和政府资助的方式筹集资金。
社会医疗保险是国家和社会根据一定的
法律法规，为向保障范围内的劳动者提供患病时基本医疗需求保障而建立哪败闭的社会保险制度。我国的社会医疗保险由基本医疗保险和大额医疗救助、企业补充医疗保险和个人补充医疗保险三个层次构成。
新型农村合作医疗，简称“新农合”，是指由政府组织、引导、支持，农民枯铅自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。采取个人缴费、集体扶持和政府资助的方式筹集资金。
社会医疗保险是国家和社会根据一定的
法律法规，为向保障范围内的劳动者提供患病时基本医疗需求保障而建立的社会保险制度。我国的社会医疗保险由基本医疗保险和大额医疗救助、企业补充医疗保险和个人补充医疗保险三个层次构成。2011年07月05日，人社部下发通知，通知说明失业者参加医保个人无需缴费。
社会医疗保险报销比例：
城镇居民基本医疗保险起付标准和报销比例按照参保人员的类别确定不同的标准。
一是学生、儿童。在一个结算年度内，发生符合报销范围的18万元以下医疗费用，三级医院起李裂付标准为500元，报销比例为55%;二级医院起付标准为300元，报销比例为60%;一级医院不设起付标准，报销比例为65%。
二是年满70周岁以上的老年人。在一个结算年度内，发生符合报销范围的10万元以下医疗费，三级医院起付标准为500元，报销比例为50%;二级医院起付标准为300元，报销比例为60%;一级医院不设起付标准，报销比例为65%。
三是其他城镇居民。在一个结算年度内，发生符合报销范围的10万元以下的医疗费，三级医院起付标准为500元，报销比例为50%;二级医院住院起付标准为300元，报销比例为55%;一级医院不设起付标准，报销比例为60%。
农村合作医疗保险：
新型农村合作医疗，简称“新农合”，是指由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。采取个人缴费、集体扶持和政府资助的方式筹集资金。
凡户籍在该地，出生90天以后的农村居民及没有参加城镇职工基本医疗保险的城镇居民均可参加(没有年龄上限)。
新型农村合作医疗是由我国农民自己创造的互助共济的医疗保障制度，在保障农民获得基本卫生服务、缓解农民因病致贫和因病返贫方面发挥了重要的作用。
报销比例：
(一)住院、门诊慢性病报销比例：
档次项目村卫生室、社区卫生服务站乡镇卫生院、社区卫生服务中心一级
(二)普通门诊报销不设起付线金额，报销比例：
档次项目村卫生室、社区卫生服务站乡镇卫生院、社区卫生服务中心一级