我只是想确定一下嘛,
1．毛利对柯南态度一直都很差，但似乎柯南从没有得罪过他，最可能的原因是他知道柯南就是工藤新一那个让小简掘兰伤心的那个高中生．基于父爱，那样的表现是很正常的
2．园子在试用一台可以预见10年后模样的机器，柯南自然闪了，但毛利硬让他试，可以看出毛利极有可能知道了柯南的真实身份 （虽然机器突然出毛病……）
3.小五郎约会杀人事件毛利干脆自己假装睡掉 而之前和他一起的只有柯南一人 显然是意识到了柯南的什么
4.很多集大叔被打针后都会说一唯让些话 比如 啊 我要开始了 或者 啊 沉睡的小五郎出现了 还有如 你还真狠心呢 好歹让我先喝一口吧 又或者是 又来了 怎么这么突然呢 好歹先大声招呼啊!
5.只要只有柯南和小五郎2个人时 小五郎对柯南的态度就大转变像是一起破案的伙伴 而每次柯南如果很认真的来和小五郎说他发现了什么 小五郎都会相信
6.TV早期某集当中小五郎曾经说过 每当我推理遇到瓶颈的时拦山核候 这个小子的一句话（当然是指柯南同学）总是给我很大的启示 这家伙绝对不是等闲之辈 他到底是什么来头？
7.记得有一集毛利的脖子痛，他说怎么老射这一个地方。表明他知道柯南用麻醉针的事。
楼上581内集纯属巧合，他本来也想念来着、
反正无论如何73没说，谁猜测都不一定对，柯南知道社的也一样。。
个人觉得“又来了”是说困意、
所以这你没法得出答案、反正现在我们知道真正知道柯南身份的就这些，自己看
吧
1. 阿笠博士（陷入困境的柯南亲口承认 001 云霄飞车杀人事件）
2.宫野明美（她临死时问柯南到底是谁，柯南回答“工藤新一，是个侦探”）013 奇怪的寻人事件
3. 工藤夫妇（阿笠博士告诉的 )043 江户川柯南被绑事件
4. 服部平次（柯南的推理能力太强，且柯链族竖南把他射晕中途醒了听到柯南用变声器说着怪怪的关西腔被发现并逼着柯南承认）57&58 福尔摩斯迷杀人事件(上、下)
5. 灰原哀（宫野志保 作为APTX的发明者，调查推理得知）129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件
6. 贝尔摩德（棚大有希子的同事也是朋友，见过新一小时候的照片）345直面黑色组织的对决里她在博士家安装窃听器并且发给柯南的邀请信直接写的是新一，且称呼柯南为唯一能摧毁组织的银色子弹，她不可能认为一个七岁小学生是银色子弹。且柯南说过“穗洞她都知道我的真实身份了，不可能不知道灰原就是宫野志保。”
7. 黑羽快斗（怪盗基德）（在TV76起了疑心，后在《世纪末的魔术师》中假扮白鸟监视柯南发现，并且为了还柯南救他鸽子的情，扮成新一帮他逃过小兰的怀疑，OVA10中对柯南说：“我终于知道你和他们（少年侦探团）平时在一起的感受了”）《世纪末的魔术师》
8. 朱蒂：很早怀疑柯南并叫柯他cool boy。在345直面黑色组织的对决中和柯南合作诱捕贝尔摩德
9. 赤井秀一（也参与了345直面黑色组织的对决并在425 被组织的魔掌触碰的瞬间中大家都追踪黑衣组织，他却一人到毛利的事务所对面埋伏。如果他不知道整个事情的来龙去脉，怎么会做出如此准确的判断）
10. FBI的头詹姆斯·布莱克＆FBI （作为朱蒂的上司朱蒂应该告诉了，在258~259 来自芝加哥的男子里他明显在试探柯南，并从FBI以后的行动看，明显对新一的身份是有默契的，不把他当成一般的小学生）在该集最后詹姆斯称柯南为cool guy guy是称呼少年的，说明他已知道柯南的秘密
11. 本堂瑛佑（推理得知，设计逼迫柯南亲口承认）505咖啡厅的死角
12.水无怜奈（CIA安插在组织的间谍）
13. 诺亚方舟（泽田弘树 已死）《贝克街的亡灵》通过诺亚方舟DNA鉴定
14. 伊东末彦 （已死 通过指纹对比得知柯南就是新一）《侦探们的镇魂歌》
15. Irish (已死 M13中先是在警视厅查了资料起疑心，后来通过指纹对比发现，没有报告组织）
16. 庄堂胡桃 在533呼唤过去的伤痕中对柯南说的一句话。（“原以为是还没变声的矮个子高中生，没想到是这么小的孩子，就好像夏洛克福尔摩斯装成小孩子的样子呢” 柯南：“是，是吗？”庄堂胡桃：“我看得见普通人看不见的东西哦。”)证明她也有可能知道柯南的身份
17.鲁邦三世&次元大介&石川五右介门&峰不二子（合作特别篇《鲁邦三世VS名侦探柯南》结尾部分）
楼上有人说“你觉得可能知道，又叫别人给出理由”，这的确是你表述有问题。。应该说清楚，同意你看法的人请给出一些理由作为支持，不同意的也请给出理由。。
很多人说毛利小五郎目前为止并不知道柯南的身份，这种说法是正确的，必竟作者没有让小五郎拆穿也没有在作品中明示，所有的暗示也最多只能是暗示，不能成为证据。但是TV版爱奇艺968-969
柯南被绑架，小五郎对目暮警官说:“在我睡觉的时候，啊不，在我推理的时候虽然被打断，但现在当务之急是把那小鬼救出来”，包括结尾毛利像对待成人一样的对待柯南的态度都最大化地暗示了毛利头脑中对於柯南身份不寻常的肯定。
综合之前几百集奄面一系列的暗示都可以说明，毛利小五郎对於柯南身份的真相只差一层窗户纸了。
但是即便是一层窗户纸也终究兆族是尚未捅破陵桐的族汪弊。既然尚未捅破，那麽便不能说毛利不知道柯南的身份，也不能说毛利已经知道柯南的身份，而应该是未看破也不说破的暧昧阶段。
柯南每次破案都是先把毛利弄睡着，就算毛利再不济，被弄昏这么多次也会产生免疫吧，说不定在破案的过程中就已经醒过来了。
从工藤新一消失的那段起,柯南就立刻出现了
并且,毛利小五郎从那之后每次破案都是在沉睡中度过
要不然就是柯南故意去提醒他
难道不起疑心吗?有谁糊里糊涂地破了案却棚嫌不闻不问?
小兰对小五郎说过：“每次爸爸做困在破案时,柯南总是不见人影.”
光是这点就够让人怀疑的了.
而且有几次,小五郎明明没说话,但是他的声音却冒了出来,紧接着就是柯南出现了,而且每次柯南在犯链胡手罪现场,都会说出他的推理,一个上二年级的小男孩有如此高的智商吗?
我想小五郎不说破的原因应该是,如果说出来,柯南可能以后再也不会帮小五郎判案了,他的侦探
生活会从此搞砸! 而且也是为了保护柯南吧，小五郎也曾经是一个刑警，身为刑警的警觉和思维应该不会因为不当刑警而消失吧。
在581 红色的摇摆目标 中，小五郎被柯南麻醉后，醒来时接着柯南的推理继续下去，其实是小五郎读别人发过来的推理短信呢
您好，我是柯南笑运橘知道社的成员碰团，很高兴解答您的问题
我觉得可能知道。因为毛利小五郎每次被柯南的麻醉针刺晕时，总会说：“又来了……”很明显他已经开始怀疑柯南了；而在最近播出的581 红色的摇摆目标 中，小五郎被柯南麻醉后，醒来时竟然能冷静地接着柯南悄卖的推理继续下去。
当然，这只是本人猜想。至于作者青山刚昌，则完全没有提到噢。
希望我的回答能给予您帮助，谢谢