芹菜根部腐烂一般有以下几种病害引起的，下面说一下这几种病害的防治方法：
一、芹菜枯萎病
发病症状：幼苗感病后，生长缓慢，严重时萎蔫或枯。成株感病，叶片无光泽，严重时叶片失去绿色或脉间叶肉出现黄绿相间班驳，刨开病茎可见维管束变褐色，根及根茎部，叶柄变为红色，根系腐烂，最后整株枯。
防治方法：选用抗枯萎病品种。采用高畦或起垄栽培。施用腐熟的有机肥雨后及时排水，严禁大水漫灌。重病地实行3年以上轮作药剂防治。
二、芹菜根腐病
发病症状：主要为害根部和茎基部，。被害处开始长生水侵状红褐色病斑，后变为暗褐色或黑褐色，稍凹陷，叶片变黄，由下往上发展，但叶片不脱落。主根被害腐烂或坏，侧根少，植株萎蔫枯，容易拔出。
防治方法：实行轮作，用无病菌土壤育苗或进行床土消毒。
药剂防治：发病初期用乾农“根尚雅”灌根防治，每7-10天一次。
三、芹菜灰霉病
发病症状：幼苗期多从根茎部发病，呈水侵状坏斑，表面密生灰色霉层。成株期发病，多从植株心叶或下部有伤口的叶片发生，初为水侵状，后病部软化，腐烂或萎蔫，病部长出灰色霉层。严重时，芹菜整株腐烂。
防治方法：加强温度、湿
管理及通风管理。具体做法为变温管理：即晴天上午晚放风，每次浇水后，进行高温闷棚，当棚温升至33度，再开始放顶风，当棚温降制25度，中午继续放风，使下午棚温保持在20-25度；棚温降至20度，关闭通风口以减缓夜间棚温下降，夜间棚温保持15-17度；阴天打开通风口焕气。浇水易在上午进行，发病初期适当节制浇水，严防过量